בחלק הראשון, הרב צמח מקדים מבוא קצר לדמותו של הרב הנזיר ואופי כתביו, כולל היחס שלו לקבלה ולמחקר. בחלק השני הרב סוקר את התפיסה של הרב הנזיר לאור "ההיגיון העברי השמעי" של השינויים והתפיסות בדורות האחרונים בעם ישראל.

בשיעור הרב צמח סוקר את המבנה של ספר אורות הקודש, מתוך הפרספקטיבה שהרב הנזיר האמין שבה צריך לקרוא אותו - תפיסה פילוסופית כוללת.

הרב הנזיר, העורך של אורות הקודש, הקפיד על חלוקה ברורה של ספר אורות הקודש לשערים וחלקים. בשיעור נלמד על האופן שבו הספר נערך, ועל היחס שנתן הרב הנזיר לכתבי הרב קוק - ספרים שאמורים להיות ספרים מונומנטליים לדורות.

בשיעור הרב צמח מפרש את ה"מערכת", מעין תוכן עניינים מילולי, שנתן הרב הנזיר לספר אורות הקודש. נראה כי התוכן בנוי מעיקר מכותרות הסדרים של הספר, אך עם שינויים קטנים המעידים על המשקל והתוכן של כל אחד מהסדרים, והמאמרים עצמם.

בשיעור זה נראה את האופן שהרב הנזיר התייחס בו למבנה הסודות המועברים באורות הקודש על ידי הרב קוק. נראה שהרוח הספרותית שבה הרב קוק כתב היא הדרך שבה הוא העביר את חכמת הקודש, והרב הנזיר ניסה להמיר אותה לפילוסופיה.

בשיעור נמשיך את העיון בכתבי הפילוסופים הרמן כהן וסוקרטס, ונראה את הדרכים הפילוסופיות השונות להבין כיצד תפיסת המציאות מאפשרת להגיע לרמה גבוהה יותר מוסרית, ובייחוד ההבנה של ה' עצמו, דרך לימוד התורה.

הרב הנזיר, העורך של אורות הקודש, הקפיד על חלוקה ברורה של ספר אורות הקודש לשערים וחלקים. בשיעור נלמד על האופן שבו הספר נערך, ועל היחס שנתן הרב הנזיר לכתבי הרב קוק - ספרים שאמורים להיות ספרים מונומנטליים לדורות.

הרב קוק באורות הקודש כתב שיש ידיעה עמוקה וגדולה יותר של המציאות מלבד המדע, העוסק במקור החיים. בשיעור נראה את הגישה של הרב הנזיר בפירוש הקטע, ובשילוב שלו בתוך אורות הקודש, מתוך קריאה של הרב הנזיר לחיבור למציאות דרך המוסר שלה.

הרב קוק באורות הקודש כתב שיש ידיעה עמוקה וגדולה יותר של המציאות מלבד המדע, העוסק במקור החיים. בשיעור נראה את הגישה של הרב הנזיר בפירוש הקטע, ובשילוב שלו בתוך אורות הקודש, מתוך קריאה של הרב הנזיר לחיבור למציאות דרך המוסר שלה.